Целокупно решење микробиолошке лабораторије разликује се од општег лабораторијског инжењеринга или инжењеринга пречишћавања према безбедносним захтевима и захтевима употребе лабораторије.Лабораторије које се углавном користе у микробиологији, биомедицини, биохемији, експериментима на животињама, генетској рекомбинацији и биолошким производима заједнички се називају лабораторијама за биолошку безбедност.Лабораторија за биолошку безбедност се састоји од главне лабораторијске лабораторије и других лабораторија и помоћних просторија.Лабораторије за биолошку безбедност морају да обезбеде личну безбедност, безбедност животне средине, безбедност отпада и узорака, дугорочан и безбедан рад, а истовремено да обезбеде удобно и добро радно окружење за лабораторијско особље.
Микробиолошка лабораторија има локалну собу за тестирање бактерија на 100 нивоа, собу за тестирање гљивица, собу за тестирање на патогене, просторију за прање и дезинфекцију, просторију за културу плесни, просторију за бактеријску културу и собу за идентификацију инструмената микроорганизама, припрему медијума за културу соба, соба за чување сојева.
